Завод Юпитер - в здании, примыкающем к территории завода Юпитер с юго-запада. Нужно подняться на верхний этаж и пройти через скопление аномалий электра. Инструменты лежат в шкафу.
Инструменты для грубой работы:

Затон - на лесопилке в доме на чердаке.

Завод Юпитер - поезд под мостом возле бункера ученых (в поезде аномалия Тесла).Проапгрейдить экзоскелет для бега можно на Скадовске у Кардана (в сочетании с артефактами: Сердце оазиса, Компас и парочкой Пузырей - лучший костюм во всех Сталкерах - хоть под пули, хоть в аномалии, хоть стометровку сдавать - все пофиг). На базе ученых техник занимается апгрейдом костюмов и шлемов (оружие не берет). На базе военных в Припяти можно бесплатно отремонтировать оружие и аммуницию (апгрейдить у военных нельзя).
предупреждаю
В универмаге целый лабиринт дверей, но там есть спуск вниз (в канализацию). Ищите. открывайте дверь проходи и не закрывай её за собой (чтобы потом не перепутать)